Genetisk analyse av fagene med autisme find gendelesjoner


Ved hjelp av kraftige genetiske sekvenseringsteknologi, et team av etterforskere, ledet av forskere fra School of Medicine ved Mount Sinai Icahn, skannet genomene til hundrevis av personer, og oppdaget dem diagnostisert med autisme spektrum lidelse (ASD) var mer sannsynlig å har gendelesjoner som var folk uten sykdommen. Dette betyr at mennesker - syv prosent av studiegruppen - hadde en kopi av ett eller flere gener, når de skal ha to.

Forskere har også rapportert i American Journal of Human Genetics, at deres analyse antyder slettinger kan føre til feilkoblinger og endret aktivitet av hjernens nerveceller.

"Dette er den første observasjonen at små slettinger virkningen av en eller to gener synes å være vanlig i autisme, og at disse slettinger bidrar til risikoen for å utvikle sykdommen," sier rektor etterforsker av studien, Joseph D. Buxbaum, PhD, professor i psykiatri, gener og Genomiske Sciences og nevrovitenskap ved School of Medicine Mount Sinai Icahn.



"Denne konklusjonen er å bli utvidet i andre uavhengige prøver av ASD, slik at vi virkelig kan forstå hvordan de plakater av risiko," sier han.

Denne prosessen pågår nå, sier Dr. Buxbaum. Autism Sequencing Consortium, en gruppe på mer enn 25 institusjoner, har blitt tildelt et stipend på $ 7,000,000 fra National Institutes of Health for å fortsette å analysere genomene til tusenvis av personer ASD på Mount Sinai.

Første titt på de manglende gener av den autistiske befolkningen autisme, som rammer om lag én prosent av befolkningen, er en utviklingsforstyrrelse antatt å være forårsaket av et komplekst samspill mellom genetiske og miljømessige faktorer. Selv om sykdommen er svært arvelig, kan de fleste tilfeller av autisme ikke tilskrives arvelige årsaker notater, sier Dr. Buxbaum.

Mens forskning har antydet at det kan være opp til 1000 gener eller genomiske regioner som bidrar til ASD, har de fleste av studiene undersøkte både for enkeltpunktmutasjoner - en endring av et enkelt brev av DNA i et gen - eller for stor områder av genomet, som inneholder mange gener som er endret.

I denne studien har forskerne undersøkt liten kopi nummer variasjon --deletion eller duplisering av genes-- mellom individer ASD og en befolkning "kontroll" uten sykdommen.

For å gjennomføre studien, brukte de exome sekvensering for å se på alle 22 000 menneskegener i utvalget, og analyserte data bruker programmet exome Hidden Markov Model (XHMM). Sammen, er den første som ikke kan finne en eneste gendelesjoner eller tilføyelser i genomet store verktøyene.

"Dette gir oss kraft, for første gang, for å kjøre en test fra en blodprøve, og sammenligne det med en referanse genom for påvisning av mutasjoner og liten kopi nummer variasjon hos pasienter," sier Dr. Buxbaum.

De brukt denne metoden for å analysere en database bestående av 431 ASD tilfeller og 379 matchede kontroller, for totalt 811 personer. De fant 803 gendelesjoner i ASD-gruppen og 583 slettinger i kontrollgruppen, og befolkningen ASD var mer sannsynlig å ha mindre slettinger.

Gendelesjoner ikke skyldes genetisk arv. "Og" nå kjent at ufullkommen antall kopier av genet er en viktig kilde til variasjon blant folk. En av grunnene til at vi er forskjellige fra hverandre på grunn av genet tillegg eller slettinger som ofte arvet ", sier . «Men jo mer vi ser i elimineringer i ASD er ikke alle på grunn av genetiske arv. Noen oppstå under utviklingen av egg eller sperm, og delesjoner som utvikles på denne måten har en tendens til å bli assosiert med sykdommen."

Forskerne så undersøkte slettinger som finnes i den autistiske gruppen og funnet ut at en betydelig andel av dem knyttet til autofagi, en viktig prosess som opprettholder sunne celler og avløste membraner og organeller.

"Det er god grunn til å tro at autofagi er svært viktig for utviklingen av hjernen, fordi hjernen produserer mange flere synapser enn nødvendig, og må beskjæres tilbake overflødig," sier Dr. Buxbaum. "For mange eller for få synapser har samme effekt som å ikke gjøre kommunikasjonen fungerer veldig bra. Det kan bety at noen synaptiske forbindelser er sent og kan ikke konsolidere dem riktig."

Forskerne mener resultatene vil ha en klinisk betydning. "Antall kopier store endringer - de som vises kontinuerlig i en autistisk befolkning - kan påvirke genetisk testing," sier Dr. Buxbaum.

4

Kommentarer - 0

Ingen kommentarer

Legg en kommentar

smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile
Tegn igjen: 3000
captcha